在审核意见中，科创板上市委要求百济神州说明三大问题：
（1）结合发行人的盈利前景及核心技术团队成员的变化情况，说明发行人正在或计划采取何种措施以保持核心技术人员与管理人员的稳定；
（2）分析三款自主研发产品百悦泽、百泽安、百汇泽未能成为各自领域在中国或美国市场最早上市产品的原因，说明该等情形是否与发行人研发、临床、报批等方面的运营效率及内部控制相关；
（3）说明发行人主要产品的市场表现、获批及临床在研适应症的最新情况、与主要竞品头对头临床试验的最新进展，说明发行人的技术优势、布局优势、价格优势能否抵消产品晚于竞品上市造成的不利影响。
从上市委的意见来看，百济神州的商业化能力被重点关注。
在此前的一场行业会议上，百济神州总裁吴晓滨也指出，对于创新药企来说，能不能做好商业化是非常重要的大考。
截至目前，百济神州的商业化产品及临床阶段候选药物共有47款，包括8款商业化阶段药物、4款已申报候选药物和35款临床阶段候选药物。其中，共有3款自主研发药物正在上市销售、8款自主研发候选药物处于临床在研阶段、以及36款处于临床或商业化阶段的合作产品。
百济神州3款处于商业化阶段的自主研发药物分别为BTK小分子抑制剂百悦泽、抗PD-1单抗百泽安、PARP抑制剂百汇泽。
百悦泽获得美国食品药品管理局（FDA）加速批准上市，于2019年11月在美国开始商业化销售，并已在阿联酋、加拿大、以色列获批上市。百悦泽和百泽安获得中国国家药监局（NMPA）附条件批准并分别于2020年6月和2020年3月在中国开始商业化销售。百汇泽于2021年5月获得中国国家药监局附条件批准。
根据财报，2016年至2020年，百济神州连续五年亏损，亏损额分别为1.19亿美元、9310.5万美元、6.74亿美元、9.49亿美元，15.97亿美元。
亏损的主要原因是研发投入的增加。2020年，百济神州的研发投入已经达到12.95亿美元。
百济神州对于研发投入的“大手笔砸钱”乃业界知名，公开数据显示，2020年国内医药企业研发投入过亿的有112家，而百济神州是目前国内上市企业研发投入最高的企业。
不过，连年亏损的百济神州在2021年第一季度首次扭亏为盈。今年5月，百济神州发布了今年一季度的财报，收入为6.06亿美元，净利润为6649.5万美元
根据一季报，百济神州此次扭亏为盈，主要得益于两方面：
一是产品收入的增长，2021年一季度，公司全球产品收入共计1.06亿美元，同比增长104%。产品收入大增得益于百泽安、百悦泽以及安加维（安进公司开发，百济神州获得其授权）进入国家新版医保药品目录后销量增加，这3款产品纳入医保以来，医院进院数量显著增加，分别达到纳入医保前的约4倍、8倍和6倍。
二是百济神州与诺华就百泽安达成的合作与授权协议正式生效，且由此获得诺华支付的6.5亿美元预付款。
那么，首次实现扭亏的百济神州，在商业化搭建上做得怎么样了？
先从最直观的销售费用来看，根据百济神州2020年财报和2021年一季报的数据，公司2020年销售、一般及行政管理费用为6.0018亿美元，上年同期为3.8825亿美元。费用的增加主要归因于员工人数的增加，部分归因于商业团队规模的扩大、专业服务费的提高和包括销售和市场营销、市场准入研究和促销活动在内的外部商业费用的增加。
截至2021年3月31日的三个月销售、一般及行政管理费用为1.821亿美元，上年同期为1.071亿美元。费用的增加主要归因于员工人数的增加，以及公司打造全球布局而不断扩大全球商业团队规模的相关费用增加。
销售费用急剧增加的背后是，销售团队的急速扩张。
招股书显示，截至2020年9月30日，百济神州的销售人员为1567人。而此前公司在回复科创板上市第二轮问询时透露，2019年销售人员的数量为814人。也就是说，在2020年的前9个月，百济神州的销售团队就一下子扩张了将近800人。有业内医药代表透露，百济神州的销售团队在2020年底已经超过1800人，作为参照对比的是，“医药一哥”恒瑞医药的肿瘤条线约2000人。